Даниил Шамкин является воспитанником «Зенита» и успел поиграть за все команды клубной структуры зенитовцев. Даниил также выступал за «Балтику», КАМАЗ и «Торпедо».

В составе «Зенита» становился обладателем Кубка России и дважды чемпионом страны.

В «Арсенале» с лета 2026 года.